Joukkotarkastusrekisteri on Suomen Syöpärekisterin osasto, joka suunnittelee, osallistuu seulontatoimintaan ja arvioi suomalaisia syöpäseulontaohjelmia.
Joukkotarkastusrekisteriin kerätään tiedot koko maan seulontakutsuista ja toteutuneista tarkastuksista. Tietoja käytetään seulontojen arviointiin ja laadunvalvontaan sekä terveyspoliittisen päätöksenteon tueksi.
Joukkotarkastusrekisteri on perustettu vuonna 1968.
Rekisterissä työskentelee 12 henkilöä.